Hội Cấp Thoát nước được thành lập ngày 7 tháng 6 năm 1988 với tư cách là một thành viên của hội Hội Xây dựng Việt Nam. Mục đích của Hội là “Tập hợp, đoàn kết, động viên khuyến khích hội viên nâng cao kiến thức, trao đổi thông tin về các thành tựu khoa học công nghệ quản lý, kinh tế…trong và ngoài nước” nhằm góp phần không ngừng phát triển ngành cấp thoát nước Việt Nam. Hiện nay Hội có hơn 230 hội viên tập thể là các doanh nghiệp làm công tác tư vấn thiết kế, xây dựng, quản lý công trình cấp thoát nước, sản xuất vật tư thiết bị chuyên ngành nước, các tổ chức đào tạo, nghiên cứu thể chế chính sách. Trong đó gồm nhiều nhà khoa học, cán bộ giảng dạy các kỹ sư, công nhân trực tiếp làm công tác cấp thoát nước với tổng số khoảng 80 ngàn cán bộ công nhân viên.
Nhiệm kỳ I, hoạt động chủ yếu là các nhà khoa học, với ý tưởng truyền đạt kiến thức cho hội viên nhằm phát triển ngành nhưng sau 6 năm hoạt động, được xem xét là không có hiệu quả thực chất. Năm 1994, Hội chuyển sang hoạt động theo hướng "Hội nghề nghiệp", bổ sung những chuyên gia có tâm huyết với ngành, có trình độ thực tiễn.
Từ tháng 1 năm 1995, Hội Cấp thoát nước Việt Nam được công nhận là hội viên chính thức của Hội nước Quốc tế, Hội nước Châu Á– Thái Bình Dương và có quan hệ nghề nghiệp với nhiều Hội Nước của các nước trên thế giới và khu vực, là thành viên chính thức của Phòng Thương mại và Công nghiệp Việt Nam.
Hội Cấp thoát nước Việt Nam đã có nhiều đóng góp vào sự phát triển công tác cấp thoát nước trong cả nước thông qua những hoạt động cụ thể như thực hiện các dự án đào tạo tại chỗ và ngắn hạn cho cán bộ, công nhân thuộc chuyên ngành cấp thoát nước; góp ý, phản biện các đề tài nghiên cứu, các dự án đầu tư cấp thoát nước quan trọng của nhiều tỉnh và thành phố; tổ chức các hội thảo trong nước theo các chủ đề kinh tế kỹ thuật, kinh nghiệm quản lý và các hội thảo quốc tế nhằm tư vấn với Nhà nước về các vấn đề thuộc cơ chế, chính sách phát triển ngành cấp thoát nước Việt Nam.
Đại Hội lần thứ hai (phát triển): Tháng 11 năm 1998 tại Thành phố Hồ Chí Minh: Ban Chấp hành gồm 39 uỷ viên.
Nhiệm kỳ II, hoạt động của Hội đã rõ nét hơn và gần như hiện nay. Tuy nhiên, do vị trí của Hội Cấp thoát nước nằm trong Hội Xây dựng nên đã có nhiều hạn chế trong quá trình chủ động phát triển cũng như quá trình hội nhập với các hội nghề nghiệp quốc tế.
Nhằm đáp ứng nhu cầu phát triển ngành Cấp thoát nước và vệ sinh môi trường góp phần thực hiện thắng lợi mục tiêu trong Định hướng phát triển cấp nước, thoát nước của Chính Phủ, đòi hỏi Hội cấp thoát nước phải nâng cao vai trò vị trí của chính mình, đổi mới nội dung, phương thức hoạt động của Hội lên tầm cao mới, hiệu quả thiết thực hơn. Vì vậy, kỳ họp II nhiệm kỳ II của BCH Hội Cấp thoát nước đã ra nghị quyết: "xin tách Hội Cấp thoát nước ra khỏi Hội Xây dựng Việt Nam" để thành lập Hội Cấp thoát nước Việt Nam.
Sau khi có ý kiến đồng ý bằng văn bản của Hội Xây dựng Việt Nam, Ban Khoa giáo Trung ương Đảng, Bộ Xây dựng, Bộ Nông nghiệp và Phát Triển Nông thôn, ngày 15 tháng 5 năm 2001, được sự uỷ nhiệm của Thủ tưởng Chính phủ, Bộ trưởng, Trưởng Ban Tổ Chức và Cán Bộ Chính Phủ đã có quyết định số 24/2001 /QĐ–BTCCBCP “thành lập Hội Cấp thoát nước Việt Nam trên cơ sở tách Hội Cấp thoát nước ra khỏi Hội Xây dựng Việt Nam”. Hôị hoạt động theo Điều lệ Hội Cấp thoát nước Việt Nam và được sự bảo trợ và quản lý nhà nước của Bộ Xây dựng, Bộ Nông nghiệp và Phát triển Nông thôn. Cơ quan lãnh đạo cao của Hội là Đại hội Đại biểu toàn quốc, Đại hội sẽ bầu ra BCH Trung ương Hội để lãnh đạo và điều hành hoạt động giữa hai kỳ Đại hội. Nhiệm kỳ của Ban chấp hành Trung Ương Hội là 5 năm.
Ngày 25 tháng 7 năm 2001, Bộ trưởng, Trưởng ban Tổ chức Cán bộ Chính phủ đã phê duyệt điều lệ Hội Cấp thoát nước Việt Nam tại Quyết định số 39/2001/QĐ–BTC–CBCP. Nhiệm kỳ II, hoạt động của Hội đã nâng tầm cao vị thế của mình bằng nhiều kết quả ở nhiều lĩnh vực như thực hiện chương trình chống thất thoát, đề xuất nhiều cơ chế, chính sách quản lý ngành nước được Chính phủ và các Bộ liên quan chấp thuận. Hoạt động của Hội vừa bảo vệ lợi ích chính đáng của Hội viên, vừa bảo vệ lợi ích Nhà nước và người tiêu dùng. Vì vậy được Bộ trưởng Bộ Xây dựng hằng năm đánh giá là:" Hội hoạt động hiệu quả nhất". Được Nhà nước tặng huân chương lao động hạng III. Bộ Xây dựng trao tặng 13 bằng khen cho các Hội viên có thành tích xuất sắc từ năm 2000- 2005.
Đại Hội lần thứ ba (hội nhập và phát triển bền vững): Tháng 9 năm 2005 tại Thành phố Huế: Ban Chấp hành gồm 49 uỷ viên.
Hội Cấp thoát nước Việt Nam có 6 Chi Hội cấp thoát nước hoặc thoát nước và vệ sinh môi trường theo vùng lãnh thổ. Đại Hội thông qua điều lệ sửa đổi đã được Bộ nội vụ phê duyệt.
Phát huy thành tích đạt được tại nhiệm kỳ II, Hội Cấp thoát nước Việt Nam đang phấn đấu thực hiện thắng lợi Nghị quyết của Đại hội III bằng nhiêu hình thức hoạt động phù hợp với đòi hỏi của Ngành nước, nhất là sau khi Việt Nam gia nhập WTO như:
- Chương trình thu hồi đầy đủ chi phí để tự chủ về tài chính, bảo đảm phát triển bền vững. Nâng cao khả năng cạnh tranh khi nước ngoài tham gia đầu tư vào ngành nước Việt Nam.
- Tiếp tục thực hiện chương trình chống thất thoát nhằm đưa mức thất thoát cấp nước xuống 30 %.
- Xây dựng các chương trình: sản xuất nước sạch an toàn vì cuộc sống của nhân dân
- Chuyển đổi hình thức tổ chức doanh nghiệp cấp thoát nước tiến tới cổ phần hoá
- Tiếp tục chương trình đào tạo và đào tạo lại đội ngũ cán bộ, công nhân cho phù hợp với yêu cầu quản lý các dây chuyền sản xuất và hệ thống cấp thoát nước theo công nghệ hiện đại.
- Tiếp tục nghiên cứu đề xuất cơ chế chính sách để lĩnh vực thoát nước, xử lý nước thải, nhằm thu hồi đầy đủ chi phí vần hành và sửa chữa bảo dưỡng hệ thống...
Nhân sự kiện Hội Cấp thoát nước Việt Nam kỷ niệm 20 năm ngày thành lập, Hội Cấp thoát nước Việt Nam xin chân thành cám ơn Bộ Xây dựng, các Bộ Ngành có liên quan; các tổ chức Quốc tế và các tổ chức phi Chính phủ khác đã phối hợp, hỗ trợ các hoạt động của Hội ngày càng hiệu quả thiết thực.